超低温保存箱的维护和保养对于延长其寿命和正常使用尤为重要，如果温度控制不准确常常导致所保存对象受损，对实验结果造成很大影响，从而影响研究工作的正常进行。
一、每月清洁一次，以保证其清洁度
用干布清除保存箱内外部和配件上的少量尘埃，如果保存箱太脏则使用中性洗涤剂，清洗后再用纯净水彻底冲洗。但不可在保存箱内部和上部冲水，否则会损坏绝缘材料并导致故障。
压缩机和其他机械部分不需要使用润滑油。清洁压缩机后部的电扇务必小心。清洁完毕后进行安全检查，确保保存箱插头插好，不要虚接；确保插头没有异常热度；确保保存箱背部的电源电线和分配电线没有破裂和刻痕。
二、警报器启动报警
当遇到警报器启动报警时，通常可通过以下方面进行检查。
1、检查电源是否有问题或插头是否被拉出插座；
2、检查内部温度计是否超出合适的范围，在此情况下，物品置人会使保存箱升温，并触发警报器；
3、检查是否一次性置人物品过多。
三、保存箱冷却不充分
检查蒸发器表面是否有冰霜；保存箱门是否开关过频；保存箱背部是否接触墙面；是否放人过多物品。
四、保存箱噪音过大
检查底板是否坚固；保存箱是否稳固；如不稳，调好活动螺丝以使四角稳固地支撑在底板上；是否有物件接触到保存箱背部。
如果制冷效果差，保存箱不停机，散热管不热，蒸发器有很小气流声，这些是因为慢渗漏造成制冷剂严重缺损的缘故。在实际使用过程中，还会遇到许多其他问题，这类问题的解决方法需要不断地积累经验方可排除障碍，使得超低温保存箱达到理想的工作状态。
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